目前结肠粘液腺癌的治愈率以及预后尚没有统一定论，国外的部分文献报道粘液腺癌的5年生存率，也就是临床治愈率大约在40%左右，国内的部分小样本数据提示5年生存率大约在20%-30%。治愈率可能与患者肿瘤部位及肿瘤分期相关。
因为目前针对结肠粘液腺癌的研究没有大样本及多医学中心的数据，入选标准及诊断标准等等不统一，所以并没有相关的权威数据。但是因为结肠粘液腺癌倾向于向周围组织浸润性生长，并且容易发生远处转移，发现时通常分期较晚，所以总体治愈率相对于非粘液腺癌差。行根治切除术及规范放化疗是提高生存率的首要方式。
数据表明结肠粘液腺癌复发率相较于非粘液腺癌也较高，并且部分结肠粘液腺癌的患者更常合并有其它器官恶性肿瘤。例如胃癌、胆管癌、宫颈癌、前列腺癌等等。所以建议结肠粘液腺癌的患者应完善相关检查排除其他器官恶性肿瘤及积极随访观察。