具有靶基因的肺癌才适合做靶向治疗。所谓靶基因就是指肺癌细胞特有的基因突变或基因异常，例如表皮生长因子受体，英文简称EGFR，在一部分肺癌患者癌细胞中发生了突变，临床上有可抑制该突变的药物，例如吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼等，这部分肺癌患者就适合采用这些药物来进行靶向治疗。这是肺癌中最常见的靶向治疗方案，也取得了不错的治疗效果。
还有少部分肺癌患者，其癌细胞的间变性淋巴瘤激酶，英文简称ALK，发生了基因融合异常，这类患者可采用克唑替尼做靶向治疗。总之，只有那些具有正常细胞所没有的基因异常的肺癌患者才适合进行靶向治疗，一般在肺腺癌患者中比较多见，而肺鳞癌、小细胞肺癌患者很少见。