甲状腺微小癌确诊之后，也应该手术治疗，需要将患侧腺体进行全切除，必要时也应该将健侧的腺体大部分切除。术中需要进行中央区淋巴结的清扫，手术当中注意避免出现甲状旁腺以及喉返神经的损伤，术后也要定期监测甲状腺功能的变化，如果出现了明显的甲状腺低功，也应该进行甲状腺激素的替代治疗，常用的是口服优甲乐片。
在治疗期间，也要注意增加饮食营养，适当进行体育功能锻炼，但是不能劳累，平时可以适当补充含碘食物，不能食用过多。另外，应该补充高蛋白食物和高热量食品，多吃新鲜蔬菜以及水果，每年复查一次颈部超声，必要时进行颈部增强CT检查，除外转移。