甲状腺切除术主要是适用于药物治疗无效的甲状腺功能亢进症、甲状腺癌、弥漫性甲状腺肿等。
甲状腺为分泌甲状腺激素器官。切除后一般引起甲状腺激素缺乏，也就是甲状腺功能低下。后期需要长期口服外源性甲状腺激素治疗
。甲状腺切除术包括次全切除、全部切除，主要根据疾病来决定。例如甲状腺癌一般多考虑行全切术并配合淋巴结清扫。
甲状腺功能亢进治疗中，部分患者因药物治疗无效，需要行手术切除治疗。弥漫性甲状腺肿患者虽然无甲状腺功能异常症状，但出现甲状腺过大压迫气管或食道时，可给予手术治疗。手术切除部分或全部甲状腺后，会引起甲状腺激素水平较前下降。但是否引起功能异常尚不肯定，如甲亢行手术治疗后可不引起甲状腺功能低下。但大部分疾病在切除后会引起甲状腺激素水平分泌下降，继发甲状腺功能低下。需要长期口服甲状腺激素治疗。