筛查是有风险的。
有关筛查的决策是很困难的。并不是所有的癌症筛查都是有益的，而且大多数还有风险。在进行任何筛查之前，最好事先与医生沟通。了解该检查的风险以及是否已被证实可以降低死于癌症的风险十分重要。
肝癌筛查的风险包括以下：
可能产生假阴性的检查结果。
即便个体患有肝癌，筛查的结果也可能显示正常。如果个体的筛查结果为假阴性（实际患有癌症，而检查结果显示未患癌症），那么即便他出现症状，仍有可能延误求医。
可能产生假阳性结果。
即便个体未患有癌症，筛查结果也可能显示不正常。假阳性结果（实际未患癌症，而检查结果显示患有癌症）可能会导致焦虑，且往往需要进行进一步的诊断性检查，而这些检查同样具有风向，例如肝活检。
诊断肝癌的操作可能引起副作用。
筛查结果异常可能需要进行肝活检来诊断肝癌，肝活检可能会引起以下罕见但严重的副作用：
医生能够对你患肝癌的风险和是否需要癌症筛查作出建议。