糖链决定细胞的特征，身体上出现糖链异常与癌细胞的分裂有一定的关联，所以通过糖链抗原检查对癌症诊断有一定意义，检查时发现糖连抗原偏高应结合其他的辅助检查来帮助诊断。
部分人是属于糖链抗原724偏高，这种情况比较容易出现在消化道癌症的患者身体上，比如胃癌、肺癌、卵巢癌、胰腺癌，但是在消化道炎症也会造成糖链抗原724出现偏高。
检查中发现糖类抗原199偏高与胰腺癌、胆囊癌有一定的关系，但是也有部分患者会因为胰腺炎、胆囊炎、肝炎等疾病造成不同程度的偏高。
患有胰腺癌、结肠癌的患者在进行检查时会发现糖链抗原242偏高，不少人也会因为结肠炎和胰腺炎而导致偏高。
糖类抗原125出现升高与卵巢癌、输卵管癌、宫颈癌等有一定的关系，同时一些妇科炎症也会造成糖链抗原125偏高。
由于炎症会导致糖链抗原偏高，所以糖链抗原偏高在癌症的诊断上是没有绝对价值的，只有参考的价值，需要结合胃镜、肠镜、ct检查确诊。