以往胶囊内镜主要是用来做小肠检查的，所以价格比较高，一般在数千元。空肠和回肠这种小肠的检查主要就是靠胶囊内镜来做。
胶囊内镜就像一颗药丸，检查时用水吞服胶囊，不会产生任何不适感觉，也不用麻醉，全程一般十几分钟，优点就是没有丝毫痛苦。胶囊在通过胃以后，继续观察小肠，有些胶囊内镜电量比较充分，可以继续观察结肠。医生根据记录仪内的几万张照片，查看胃肠黏膜的情况。做完检查后胶囊随粪便排出体外。
目前有些胶囊内镜具有可操控性，即所谓磁控胶囊内镜，需要在医院里有医生调控，控制胶囊在胃内的运动和方向，可以仔细观察胃内的各个部位的黏膜情况。
正规的胶囊内镜成本都在数千元，所以，对号称几百元的胶囊内镜，请谨慎采用。
在选择做胶囊胃镜的时候建议选比较正规的大医院，不要因为钱的差异，就去选择一些小型没有营业执照的医院。因对胃肠内的图像的观察不仔细，一生的经验不够丰富可能会漏诊病变。