甲状腺癌的治疗目的是消除患者体内的癌细胞。医生会根据患者年龄、肿瘤类型、分期及健康状态等情况，选择不同的治疗方案。大部分患者需要手术切除部分或全部甲状腺。有时也会切除可疑结节或淋巴结进行检查，诊断是否为癌症。
常用治疗方案包括以下几种：
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手术
手术是甲状腺癌最常用的治疗手段，手术方式包括：
- 甲状腺叶切除术：切除肿瘤所在的甲状腺叶。医生可以对该区域的淋巴结进行活组织检查，以确定它们是否含有癌细胞。
- 甲状腺近全切除术：仅保留一小部分甲状腺，其余全部切除。
- 甲状腺全切除术：切除全部甲状腺。
- 淋巴结清除术：清除含有癌细胞的颈部淋巴结。
放射性碘治疗
术后可能需要接受放射性碘(radioactive iodine，RAI)治疗，以消除残余的癌细胞，可以治疗滤泡状和乳头状癌。只有甲状腺组织吸收碘，患者口服摄入放射性碘(I-131)，就可以破坏残留在甲状腺组织和转移到身体其他部位的癌细胞。
手术几周后才能进行放射性碘治疗，期间可能会出现疲劳、虚弱、体重增加、抑郁、记忆力减退和便秘等症状。
化疗和放疗
化疗通过药物来阻止癌细胞生长，既可以杀死癌细胞，也可以阻止它们分裂。药物通过口服或注射（静脉或肌肉）进入血液，并送达全身（称为“全身化疗”）。而当医生将化疗药物直接注入脑脊液、器官或腹腔等部位时，主要杀灭这些区域的癌细胞（称为“局部化疗”）。医生依据肿瘤类型和病情阶段来选择化疗方式。
放疗是甲状腺癌的治疗方法之一，通过高能量X射线或其他类型的放射线来杀死癌细胞或防止癌细胞生长。可在术后进行，杀死未被切除的癌细胞。放疗有两种类型。外部放疗使用机器从体外对肿瘤进行照射。内部放疗是将密封在针头、粒子、或导管中的放射性物质直接放入肿瘤部位或其附近位置。医生依据肿瘤类型和病情阶段选择放疗方式。
内分泌治疗（TSH 抑制治疗）
甲状腺激素是由甲状腺分泌并释放入血液循环的激素，接受甲状腺近全切除或全切除的患者术后会出现甲状腺激素分泌不足的情况，而促甲状腺激素(thyroid stimulating hormone，TSH)分泌会增多，TSH可通过其受体刺激甲状腺癌生长或增加复发的机会。因此，接受甲状腺近全或全切除的患者需要终身服用甲状腺素片，以达到预防甲状腺功能减退和抑制 TSH 的目的。
靶向治疗
靶向治疗是指通过使用药物或其他物质来识别和攻击特定的癌细胞，而不伤害正常细胞。酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor，TKI)是靶向治疗的一种，这类药物可阻断肿瘤生长所需的物质供应来抑制肿瘤生长，并促进细胞凋亡。凡德他尼(vandetanib)和索拉非尼(sorafenib)是主要用于治疗某些类型甲状腺癌的 TKI。
随访和复查
接受上述常规治疗后，需要进行 6~12 个月的随访。除了定期复查，如果发现颈部出现肿块或发生呼吸、吞咽困难等症状，一定要及时与医生联系。
复查时，可能需要做血液指标检查来了解 TSH 水平，帮助医生确定甲状腺素剂量是否合适。医生也可能会建议做一些其他检查，如 X 线检查、CT 等。
常规治疗之外，医生还会采取针对副作用的治疗
手术
术后疼痛一般很轻微，通常也只会持续几天。医生会处方止疼药来缓解疼痛。术后可能需要终身进行甲状腺激素替代治疗。
放射性碘治疗
放射性碘治疗后，患者可能在一段时间内具有“辐射性”。医生会指导患者如何在生活中减少对他人的辐射影响。
内分泌治疗
如果按照正确剂量服用，内分泌治疗出现副作用的可能性非常小。剂量过多可能导致心动过速或心律异常，长期过量服药还可能导致骨质疏松。
家庭治疗有助于缓解治疗副作用。
患者还可能接受或选择以下治疗：
病情恶化时的治疗
甲状腺癌可能会复发。通过体格检查、超声和甲状腺球蛋白水平上升可以发现。不要紧张，甲状腺癌复发通常是可以治愈的，尤其是仅转移到颈部淋巴结时。
当肿瘤转移到身体其他部位时，则可能需要进行手术、放射性碘治疗、化疗和放疗等。
临床试验
医生可能会建议参加临床试验。临床试验是癌症研究过程的一部分，医生借此可以确定新的癌症治疗方案是否安全有效、或优于标准治疗方案。对于一些患者，这可能是最好的选择。目前，甲状腺癌的临床试验正在研究TKI的靶向治疗。
支持性治疗
这是为病情严重患者提供的一种治疗方式。它的目的不是治愈疾病，而是从身、心两方面提供照护，提高生活质量。患者可以在接受常规治疗时，也可以在常规治疗效果不理想时接受支持性治疗。
医护人员会缓解患者的疼痛和副反应，并帮助选择治疗方案。他们还会告诉亲属如何给予患者支持和鼓励。