肝癌患者的预后与患者的总生存期密切相关，影响肝癌患者预后的因素包括基础肝病、肿瘤生物学特性、治疗方法的选择与疗效、机体免疫状况、患者因素等。
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基础肝病
众所周知，肝癌大多数是在慢性肝炎、肝硬化背景下发展而来。
在首次发现肝癌时，患者肝功能状态越好，肝硬化程度越轻，意味着患者能接受抗肿瘤治疗的机会越多，接受治疗的时间也越长，对患者的预后也更有益。
肿瘤生物学特性
每个患者所患肿瘤的生物学特性并不一致。
- 有些患者的肿瘤为单中心发生，恶性度低，具备“治愈性”治疗的条件，在选择适合的方法治疗后，肿瘤不再复发或复发率很低，这类患者预后就更好。
- 如果患者为多中心发生的肿瘤，恶性度高，侵袭性强，容易发生复发或转移，这类患者的预后则较差。
治疗方法的选择与疗效
肝癌的治疗方法很多，包括肝移植、肝癌切除、射频消融等“治愈性”方法，以及介入、瘤内无水酒精注射、放疗、系统性化疗、靶向药物、免疫治疗等各种“姑息性”方法。
各种方法都有其适应证和禁忌证，因患者肿瘤状况的不同而疗效各异。不同的方法对患者肝功能都有不同程度的影响，患者治疗前的肝功能状态与治疗后患者的恢复也密切相关。
机体免疫状况
患者机体的免疫状态与治疗后肿瘤的复发与转移密切相关。
患者因素
有些患者，由于各种原因不能按照医嘱定期随访检查，贻误最佳治疗时间，导致病情进展，影响预后。