糖尿病病人由于控制胃肠道自主神经病变，往往有排便障碍，以便秘多见，也有的表现为腹泻，或者是腹泻与便秘交替出现，让患者痛苦不堪。比如不少患者是经常性的便秘，几天大便一次，大便干硬结球，吃了泻药，就腹泻不止，然后大便更干，老没有好的时候。有的表现为清晨腹泻，中医称做“五更泻”。
通常治疗方法包括：
（1）控制好糖尿病，减少或延缓自主神经病变的发生和发展；
（2）多吃富含膳食纤维的食品，以利通便；
（3）养成良好的大便习惯。有人认为，清晨起来喝一杯温开水，不管有没有便意，十分钟后入厕，这样养成良好的大便习惯，对保持大便通畅十分有效，患者不妨一试；
（4）B族维生素。据说对保持大便正常有效；
（5）大便秘结者可采取通便措施，包括使用通便剂，如新清宁、通便灵、麻仁润肠丸、麻仁滋脾丸等，晚间一次服用。注意不要等到大便已经很干时再使用，到那时候少量通便药效果不佳，多吃了通便药有会引起腹泻。最好不用峻泻剂如硫酸镁等，酚酞和果导片对糖尿病病人来说也会引起腹泻，最好也不用，以免泻后大便更干。
便秘的同时有腹胀、吃完的饭堵在上腹“不往下走”等症状，可能是因为胃肠蠕动慢所造成的，可用些吗丁啉、胃复安（灭吐灵）等药物，开塞露对身体影响不大，也可以使用；
（6）腹泻。可用些收敛剂，如可乐定、山莨菪碱（即654―2）、铋剂（如次碳酸铋）、易蒙停、黄连素等；
（7）中药治疗大便失常很有见地，分阴阳、实虚、气血、脏腑，因人而异地进行治疗。