不同手术方式切除的部位和范围是不同的：全胃切除即切除全部的胃；部分切除包括远端胃大部切除术和近端胃大部切除术，顾名思义，分别切除靠近胃出口和入口的大部分胃，以及周围的一些淋巴结等。由于切除部位不同，消化道重建的方式也存在差异，也就是说，会把消化道的不同部位进行吻合。
不同手术方式的常见并发症也有区别：晚期倾倒综合征是全胃切除术后的一个主要并发症，常在进食后数小时发生，表现为乏力、眩晕、冷汗等；远端胃大部切除术后可能出现吻合口狭窄（进食后上腹部胀满、打嗝、呕吐）、肠梗阻（腹痛、腹胀、呕吐、停止放屁）；近端胃大部切除术后则可能出现反流性食管炎，表现为胸部后疼痛、吞咽困难等。
至于对胃功能的影响，除全胃切除术后患者更易出现维生素 B12 缺乏外，研究并未显示有其他差别。