1、分化型甲状腺癌的手术治疗（乳头状癌和滤泡状癌）
手术前，美国甲状腺学会和欧洲甲状腺学会的指南均建议进行颈部超声，仔细检查颈部中央区和侧方的淋巴结是否存在转移。成年患者和儿童患者均需如此。有的医生也会采用其它影像学手段，如 CT 检查。
非微小甲状腺癌的治疗常常需要甲状腺全切或近全切。对乳头状甲状腺微小癌或可疑恶性的甲状腺结节，患癌侧腺叶切除术可能已经足够。上海第十人民医院甲状腺疾病诊治中心殷志强
此外，手术当中外科医生通常会检查淋巴结是否存在肿大。
外科医生会根据肿瘤的大小以及是否存在甲状腺转移和/或附近颈部组织侵袭，改变手术的范围。颈部软组织的肿瘤常常可在不损伤颈部肌肉或喉返神经（支配声带运动）的情况下被切除。
外科医生会切除看上去异常或活检证实为发生转移的淋巴结。美国甲状腺学会和欧洲甲状腺学会均建议：如果发现了淋巴结转移，就应当把区域内所有淋巴结均切除掉。
对肿瘤侵袭程度较高的患者，有的外科医生会预防性切除所有中央区淋巴结。
2、甲状腺髓样癌的手术治疗
手术切除甲状腺是甲状腺髓样癌的治疗选择。
外科医生对几乎所有的术前确诊为甲状腺髓样癌的患者，都将切除其颈部淋巴结。
但是一旦甲状腺髓样癌已经转移到淋巴结，再次手术通常也不能治愈。
【手术的风险】
外科医生的甲状腺手术经验越多，手术并发症的风险越低。但是，即便是最有经验的外科医生，也可能会发生手术并发症。
一些风险：
暂时或永久的声音嘶哑或失声：由喉返神经受损伤所致。喉返神经是紧邻甲状腺的一条神经。
语音质量的改变常常是暂时的。少见病例为永久性改变。
如果神经受损，可采取一些矫正措施。
如果双侧神经均受损，一些患者可能出现呼吸困难而需要气管切开。这种情况非常罕见。
低血钙：由甲状旁腺受损伤所致。
甲状腺背面有四个甲状旁腺。甲状腺切除时，外科医生会仔细确定甲状旁腺的位置并力争其不被损 伤或切除。 低血钙的症状包括肌肉抽搐、麻木感，尤其好发于手、足。甲状旁腺损伤导致“甲状旁腺功能低下”。
甲状旁腺功能低下可通过补充钙剂和特殊形式的维生素 D 来治疗。
低血钙通常是暂时的，补钙和补维生素D治疗一般仅需持续 2-4 周。
但是，一小部分患者术后可能出现永久性甲状旁腺功能低下，需终生补充钙剂和维生素D。
感染：少见的并发症。应用抗生素治疗。
出血：少见的并发症。术中或术后止血处理。 最好找到一位甲状腺手术经验丰富的外科医生来操作，有助于降低风险、保证手术效果。
【术后恢复】
多数甲状腺手术住院时间很短。
医生会指导患者如何进行伤口护理，告诉患者术后如何活动，以及何时可以恢复正常活动。
医生会指导患者何时需要复诊。出院前，患者应当知道术后复诊的日期和时间。
住院期间、返家途中和在家里，选择舒适的枕头。
休息、注意营养、喝足够的水、不要过多活动有助于术后恢复。
患者应忌烟酒及刺激性食物，避免过度劳累，保持充足睡眠，适当锻炼增强抵抗力，防止因感冒引起咽部充血、不适。
颈淋巴结清扫术后病人，在切口愈合后开始肩关节和颈部的功能锻炼，防止瘢痕收缩，一般术2–3月应避免颈部做剧烈活动。
全甲状腺切除的病人，应遵医嘱服用甲状腺制剂作替代疗法。服药期间若出现心慌、怕热等不适时，应及时到医院检查。
患者在术后3个月、6个月、1年进行复查，以后每年随诊1次，共5年，此后可每2–3年随诊1次。