在临床当中，便秘和腹泻的症状交替出现，常见功能性消化不良，如肠易激综合征、结肠癌等疾病。治疗方式皆不同，需要完善肠镜检查，尽早明确诊断，针对性的治疗。
如果只是近期出现的，多和患者饮食不当、情绪刺激或者天气的影响有关，引起短暂性的胃肠功能的紊乱，出现便秘和腹泻交替出现，通常2-3天的生活方式的调节，就可以康复。
如果反复出现便秘和腹泻的时间较长，大便不带血，和饮食无明显的关系，考虑肠易激综合征所引发，这是一种功能性的肠道疾病，多见于青年人，而且家族有病史的患者容易出现类似疾病。目前的治疗也只是对症支持为主，如果患者腹泻可以予止泻药物，如果患者便秘给予通便药物，必要的时候可以抗焦虑的精神药物。
结肠癌患者也可以在早期出现便秘和腹泻交替，常伴有大便带血、食欲差、逐渐消瘦等表现。