胶囊胃镜属于新一代的内镜检查技术，不需要插管，所以也没有明显痛苦，检查过程中只需随水吞服一颗”药丸”，在它经过食道、胃、肠时候，就可以通过拍照把胃里面看的清清楚楚，所以是一项非常先进的检查技术，但是也有缺点：
1、不能随医生的意图控制方向，如果一般的胃镜，某个细微的地方看不清楚或者有疑似病变，可以耐心的慢慢找。但是胶囊胃镜是不受控制的，在它进入食道和胃的过程中会不断拍照，某些角落有可能会遗漏，所以说胶囊胃镜没有常规胃镜看的清楚、细致。
2、胶囊胃镜不能做黏膜组织活检检查，胶囊胃镜只能拍摄到病变，但是不能确认组织学，要进一步确定则还需要做胃镜做组织学检查。不像普通的胃镜，检查到息肉或者肿物，可以立刻通过活检来确诊是良性还是恶性，这个对患者来说非常重要，如果是恶性肿块，及早的发现，及早的治疗，就不会造成更大的危害，一般都会取得较好的效果。
胶囊胃镜属于一项新的技术，有其不可比拟的优势，但是成本比较高，所以费用也比较贵。也不能完全取代常规胃镜。